于1999年11月26日成立，是根据国务院机构改革方案，由原秦皇岛进出口商品检验局、秦皇岛动植物检疫局、秦皇岛卫生检疫局（简称"三检"）合并组建的，是国家质量监督检验检疫总局垂直领导、河北检验检疫局直接管理的分支局，主要负责秦皇岛地区的出入境卫生检疫、动植物检疫和进出口商品检验、鉴定、认证、认可和监督管理，是国家设在秦皇岛口岸的副厅级行政执法机构。

    秦皇岛检验检疫局机关设有办公室、人事处、法综处、财务处、政工处、监察审计室、认证监管处、卫检处、动检处、植检处、食品处、工矿处、鉴定处13个行政及业务处室；设有检验检疫技术中心、国际旅行卫生保健中心、机关服务中心、煤检中心、商检公司、秦检公司等6个企事业单位。现有干部职工300人，其中，70%以上是学有专长的专业技术人员，90%具有大专以上学历，14人具有博士和硕士学位；

    全局拥有实验室32个，其中，石油化工、矿产金属材料实验室被美国ASTM列入世界实验室名录；价值2000元以上的检验检疫仪器设备1300多台（套），各类大型高精尖仪器60多台，总价值达8000多万元。实验室可对4000多种出入境动植物及其制品、进出口商品进行感官、物理、化学、微生物、农药、兽药残留及各种毒素的检验和鉴定，能对出入境动植物及其产品、运输工具、出入境人员等实施检疫，作为一个门类齐全，实力雄厚的综合性检验检疫机构，为完成国家赋予的出入境检验检疫把关任务，为秦皇岛对外开放和对外经济贸易的发展发挥了重要作用。